丽江市环境保护局，位于丽江市古城区象山东路。原依据丽江行政公署《关于丽江地区行署城乡建设与丽江地区 行署环境保 护局分设的通知》丽地机编（1997）18号文设立，即丽江地区行政公署环境保护局。核定人员编制10 人，正、副局长岗位2名，下设局办公室、环境管理科、自然保护科。二00二年二月，经行政部门机构改 革，行署《关于丽江地区行署环境保护局职能配置、内设机构和人员编制方案的批复》丽署复[2002]26 号文，重新核定人员编制10名，核定领导职数：正、副局长各一名，科级领导4名。下设三科一室：局办公室、污染控制科、自然生态保护科、法制宣传科。
    二00三年四月，地区机构编制委员会《关于核增丽江地区行署环境保护局编制的通知》丽地机编 办（2003）18号文，由原来10名的编制数增加为13名。到2003年6月，丽江“撒地设市”，改为丽江市环境保护局。